Page 49 - Multidisipliner Covid 19

SARS-CoV-2 Özellikleri ve Laboratuvar Tan›s›

Enfeksiyonun çok erken döneminde veya alt solunum yoluna ilerlediği
dönemde (genellikle ikinci haftada) bazen yanlış negatiflikler görülebilir.
Hastanın COVID-19 pnömonisiyle uyumlu klinik bulguları, radyolojik
bulguları veya şüpheli temas öyküsü varsa yeni bir örnekletestin tekrar-
lanması önerilmektedir. Mümkünse balgam, endotrakeal aspirat veya
bronkoalveolar lavaj (BAL) gibi bir alt solunum yolu örneği alınması tanı
için daha değerli olacağından tavsiye edilmektedir. Özellikle BAL örnekle-
rinde pozitiflik oranı ve viral yük değerleri daha yüksektir (42, 43, 46 ,47).

Bazı ağır COVID-19 vakalarında solunum örneklerinin yanı sıra, gaita/rektal
sürüntü ve serum örmeklerinde viral RNA tespit edilebilir. Gastrointestinal
bulguların klinik tabloya eşlik ettiği/etmediği bazı hastaların gaita
örneklerinde SARS CoV-2 saptandığı bildirilmiştir (43, 48). Ancak bu
örneklerin tanı değeri ve klinik yararlılığı belirsizdir. Rektal sürüntülerin
enfeksiyonun geç dönemlerinde enfektivite veya tedavi takibi göstergesi
olarak rolünün anlaşılması için yeni çalışmalar gerekmektedir. Gerek
düşük pozitiflik oranları gerekse testlerin standardizasyon sorunları
nedeniyle bu örneklerin rutin tanı uygulamalarında henüz karşılıkları
bulunmamaktadır (41, 48, 49). Örnek alımı sırasında olası bulaş riski de
düşünülerek kişinin kendi nazal, tükrük veya ağız çalkalama suyunu
alması gibi alternatif seçenekler söz konusu olsa da duyarlılıkları ve
güvenilirlikleri düşük olduğundan bu yöntemler pek tercih edilmemektedir.

6.2. Hücre kültürü

Virüsün izolasyonu, viral partiküllerin görüntülenmesi, replikasyon
döngüsünün anlaşılması, aşı ve antiviral ajanların geliştirilmesi için hücre
kültüründe virüsün üretilmesi önemlidir (24, 42, 50) (Tablo 2). SARS-CoV-
2 uygun hücre dizilerinde standart hücre kültürü yöntemleriyle
üretilebilmektedir. Vero hücrelerinde üretilen virüsün üçüncü günde
sitopatik etki oluşturduğu gösterildi.Bu hücrelerin elektron mikroskobuyla
incelenmesi SARS-CoV-2’nin özgün morfolojik yapısının ve replikasyon
sürecinin daha iyi anlaşılmasını sağladı (24, 50).

Donanımlı laboratuvar koşulları, iş gücü ve uzmanlık gerektirmesi ve
biyogüvenlik riskleri nedeniyle rutin tanı amacıyla hücre kültürü yapıl-
mamaktadır.

48