Page 41 - Multidisipliner Covid 19

SARS-CoV-2 Özellikleri ve Laboratuvar Tan›s›

Şekil 5. Vero hücre kültüründe üreyen SARS-CoV-2'nin sitopatik etkileri
ve elektron mikroskobundaki görüntüsü. A:Vero hücre kültürü, negatif
control (B) SARS-CoV-2 inokülasyonundan üç gün sonra hücrelerin
yuvarlaklaşması ve dökülmesi şeklinde gözlenen sitopatik etkiler. C,D:
Enfekte Vero hücrelerinin transmisyon elektron mikroskopisi görüntüsü;
Beyaz üçgen oklar nükleer membranı, siyah üçgen oklar hücre dışı virüs
partiküllerini, ince siyah uzun ok sitoplazmik vezikülü ve kalın siyah
okbüyütülmüş virüs partiküllerini (D) gösterir. SARS = şiddetli akut
solunum sendromu, CoV = koronavirüs.(kaynak 24’den alınmıştır) (Park
WB, Kwon NJ, Choi SJ, et al. Virus Isolation from the First Patient with
SARS-CoV-2 in Korea. J Korean Med Sci. Feb 2020; 35(7):84.
https://doi.org/10.3346/jkms.2020.35.e84)

5.2. Genom Yapısı

Virüsün genomu sarmal (helikal) simetrili, pozitif polariteli, tek zincirli
29.9 kilobaz uzunluğunda bir RNA’dan oluşmaktadır. 5’ uçta kep, 3’ uçta
poli-A kuyruğu vardır (Şekil 6) (25). Genom 9680 amino asit poliproteini
kodlayan açık okuma bölgeleri (open reading frame: ORF) ve 265 ve 358
nükleotidlik iki okunmayan bölge (untranslated region: UTR) içerir.
Genomun 5’ ve 3’ ucunda UTR bölgeler yeralır. Genomun yaklaşık %
67'sini oluşturan birinci ORF 16 yapısal olmayan proteini kodlar, diğer
ORF'lar ise yapısal proteinleri kodlar. 5’ ucundaki ORF 1 (ORF1a ve
ORF1ab) bölgesinden kodlanan tek bir poliprotein, daha sonra işlenerek
bölünür ve 16 yapısal olmayan proteine (nsp: non-structural protein)
çevrilir. Yapısal olmayan proteinler RNA bağımlı RNA polimeraz (RdRp),
helikaz (HE) gibi transkripsiyonda ve replikasyonda yer alan proteazlardır.

40