Page 39 - Multidisipliner Covid 19
P. 39
SARS-CoV-2 Özellikleri ve Laboratuvar Tan›s›
Mevcut kanıtlar, Huanan Deniz Ürünleri Toptan Satış Pazarında yasadışı
olarak satılan vahşi hayvanlara işaret ediyor olsa da SARS-CoV-2'nin
kökeni konusunda epidemiyolojik ve etiyolojik araştırmalar sürmektedir
(15). Devam etmekte olan pandemide, farklı ülkelerden/bölgelerden izole
edilen SARS-CoV-2 suşlarının evrimsel ilişkilerini gösteren filogenetik ve
biyoinformatik analizler yapılmakta, olası kaynaklar ve coğrafi yayılım
yolları tespit edilmeye çalışılmaktadır (13, 23).
5. SARS CoV-2’nin Özellikleri
5.1. Morfolojisi
Virüs partikülleri 70-90 nanometre çapında küre şeklinde, dış yüzeyinde
dikensi çıkıntılar şeklinde glikoprotein uzantılara sahip görünmektedir.
Virüs pozitif polariteli, tek sarmallı bir RNA genomu, onu çevreleyen
kapsit ve zarf yapısından oluşmaktadır (Şekil 4)(15). SARS-CoV-2 virüs
partikülleri Vero hücre kültüründe üretilerek üçüncü günde sitopatik
etkiye sebep olduğu gösterildi (Şekil 5) (24).
Viral partikülün en dışında bulunan viral zarf, çift tabaka fosfolipit kat-
manlarından oluşmaktadır. Virion dört ana yapısal protein içerir: Viral
zarfa gömülü olarak bulunan ve dışa doğru uzantılar göstererek virüse
karakteristik yapısını kazandıran glikoproteinler (spike: S); iki alt birimden
oluşurlar (S1 ve S2) ve konak hücreye girişten (tutunma ve füzyon) sorum-
ludurlar.
Zarf proteinleri (E) ve kapsitle ilişkili membran proteinleri (transmembrane
protein: M) virüs morfogenezi, sentezlenen viral yapıların bir araya gelmesi
ve birleşmesi (assembly) ve tomurcuklanmada rol alırlar. Nükleokapsid
(N) protein nükleokapsidi oluşturan esas protein olup sarmal yapıdaki
RNA’yı paketlemektedir. N proteini viral RNA'nın replikasyonunda, viral
patogenezde görev alır ve konağın viral enfeksiyona hücresel yanıt oluştur-
masında rol oynar. Bazı CoV gruplarında, özellikle de Betakoronavirüs
A alt soyunda, yüzey glikoproteinlerine benzeyen ancak daha kısa olan
zarfla ilişkili hemaglutinin esteraz (HE) proteinleri de bulunur. HE SARS-
CoV-2’de bulunmaz (4, 15, 24).
38
